På trods af sine hårdføre egenskaber bliver enebær lejlighedsvis angrebet af sygdomme. De er forårsaget af forskellige svampe og kan godt bekæmpes, hvis de opdages tidligt.

Almindelige sygdomme:
- tilbagegang
- Enebær boblerist medfølger
- pæreriste og
- Tjørn rist
tilbagegang
Svampen Phomopsis juniperivora er ansvarlig for denne sygdom. Sporerne koloniserer nålene på unge planter. Disse bliver først brune og senere gulbrune til grå. Nålene forbliver og falder ikke af. Efter blot et par dage kan sorte frugtlegemer ses på de døende nåle og bløde skud. Tilbagegang kan ofte ses hos enebær fra Virginia. Berørte plantedele bør generøst fjernes og bortskaffes.
enebær blister rust
Bag denne sygdom er to typer rustsvampe, der koloniserer forskellige enebærarter. Rustsvampe er karakteriseret ved et værtsskifte. Forskellige træer og buske er nødvendige for en vellykket formering. Bekæmpelse af disse svampesygdomme er den samme for begge arter.
pærerist
Sygdommen skyldes rustsvampen Gymnosporangium sabinae, som optræder på enebærtræer om foråret. Det kommer til udtryk ved fortykkelse af de træagtige skud. Under fugtige forhold svulmer sporelagrene op til gelatinøse blærer. De udvikler små sporer, der overføres til bladene på pæretræer i blæsevejr.
Pærerust påvirker fortrinsvis:
- Juniperus sqamosa
- Juniperus chinensis
- Juniperus media
Tjørn rist
Denne svampesygdom er forårsaget af arten Gymnosporangium clavariiforme. Sporerne foretrækker at slå sig ned på tjørn mellem april og september. I foråret er der værtsskifte. Svampen koloniserer skuddene på Juniperus communis og udvikler tungeformede sporebede, der lyser orange. I fugtigt vejr svulmer de og har en geléagtig konsistens. Under tørre forhold mister sporelagrene vand og krymper.
kontrol og forebyggelse
I de fleste tilfælde kan man klare sig uden at slås, for størstedelen af alle ramte prydtræer overlever godt et angreb med rustsvampe. Berørte grene skæres ud, så svampen ikke kan formere sig yderligere. Hvis angrebet spreder sig fra skuddene til bladene eller roser er i nærheden, bør du ty til pesticider.
Regelmæssig sprøjtning med padderoksafkog har vist sig at være en forebyggende foranstaltning. Ekstraktet injiceres, så snart bladene spirer. Kaliumgødskning kan også bruges forebyggende.